长期以来 ,DNA测序技术一直是分子生物学相关研究中最常用的技术手段之一 ,从一定程度上推动了该领域的快速发展 。人类基因组计划 、转录组分析 、微生物基因组重测序 、的多态性 (single nucleotide polymorphisms,SNP) 分析等方面也促进了其他生物学领域的研究和发展 。每一代测序技术的更替都标志着生物学中基因芯片 、数据分析 、表面化学 、生物工程等技术领域有了新的突破 ,从而应用在了测序领域 ,大大降低了测序成本 ,提高了测序效率 ,使测序向着高通量 、低成本 、高安全性和商业化的方向发展 。
第二代测序(Next-generation sequencing ,NGS)又称为高通量测序(High-throughput sequencing) ,是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术 。亚洲必赢都知道一代测序为合成终止测序 ,而二代测序开创性的引入了可逆终止末端 ,从而实现边合成边测序(Sequencing by Synthesis) 。二代测序在DNA复制过程中通过捕捉新添加的碱基所携带的特殊标记(一般为荧光分子标记)来确定DNA的序列 ,现有的技术平台主要包括Roche的454 FLX 、Illumina的Miseq/Hiseq等 。由于在二代测序中 ,单个DNA分子必须扩增成由相同DNA组成的基因簇 ,然后进行同步复制 ,来增强荧光信号强度从而读出DNA序列 ;而随着读长增长 ,基因簇复制的协同性降低 ,导致碱基测序质量下降 ,这严格限制了二代测序的读长(不超过500bp) ,因此 ,二代测序具有通量高 、读长短的特点 。二代测序适合扩增子测序(例如16S 、18S 、ITS的可变区) ,而基因组 、宏基因组DNA则需要使用鸟枪法(Shotgun method)打断成小片段 ,测序完毕后再使用生物信息学方法进行拼接 。
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